Pracownicy Katedry Postępowania Karnego i Prawa Karnego Wykonawczego poświęcają czas nie tylko prowadzonym przez siebie badaniom naukowym oraz realizacji zajęć dydaktycznych ale również prowadzą koła naukowe. Celem działalności kół prowadzonych w Katedrze jest poszerzanie zainteresowań studentów oraz umożliwienie im pogłębienia własnej wiedzy z zakresu szeroko rozumianego postępowania karnego, prawa karnego wykonawczego oraz psychologii sadowej. Realizację tych celów w kołach naukowych prowadzonych w Katedrze umożliwiają nie tylko spotkania i rozmowy studentów z pracownikami naukowymi ale również prezentacje przez zaproszonych specjalistów wybranych zawodów prawniczych, uczestnictwo w prawdziwych postępowaniach na sali rozpraw Sądu Rejonowego w Olsztynie oraz Sądu Okręgowego w Olsztynie, wizyty w zakładach karnych i aresztach śledczych (m.in. w Olsztynie, Barczewie), czy w wybranych jednostkach Policji.

Obecnie w Katedrze Postępowania Karnego i Prawa Karnego Wykonawczego działają cztery koła naukowe: Koło Nauk Penalnych „Nemezis”, którego opiekunem naukowym jest dr hab. Krystyna Szczechowicz, prof. UWM, Koło Naukowe Nauk Penalnych „Custodia”, którego opiekunem jest dr Robert Szostak, Koło Naukowe Psychiatrii Sądowej, którego opiekunem jest dr hab. Elżbieta Żywucka-Kozłowska oraz Koło Naukowe Postępowania Karnego „Accusatio”, będące pod opieką naukową dr Rossany Bronieckiej.