Pracownicy Katedry Postępowania Karnego i Prawa Karnego Wykonawczego poświęcają czas nie tylko prowadzonym przez siebie badaniom naukowym oraz realizacji zajęć dydaktycznych ale również prowadzą koła naukowe. Celem działalności kół prowadzonych w Katedrze jest poszerzanie zainteresowań studentów oraz umożliwienie im pogłębienia własnej wiedzy z zakresu szeroko rozumianego postępowania karnego, prawa karnego wykonawczego oraz psychologii sadowej. Realizację tych celów w kołach naukowych prowadzonych w Katedrze umożliwiają nie tylko spotkania i rozmowy studentów z pracownikami naukowymi ale również prezentacje przez zaproszonych specjalistów wybranych zawodów prawniczych, uczestnictwo w prawdziwych postępowaniach na sali rozpraw Sądu Rejonowego w Olsztynie oraz Sądu Okręgowego w Olsztynie, wizyty w zakładach karnych i aresztach śledczych (m.in. w Olsztynie, Barczewie), czy w wybranych jednostkach Policji.

Obecnie w Katedrze Postępowania Karnego i Prawa Karnego Wykonawczego działają trzy koła naukowe: Koło Nauk Penalnych „Nemezis”, którego opiekunem naukowym jest dr Kornelia Grabowska-Biernat, Koło Naukowe Psychiatrii Sądowej, którego opiekunem jest dr Malwina Treder oraz Koło Naukowe Postępowania Karnego „Accusatio”, będące pod opieką naukową dra Roberta Dziembowskiego.